沒想到，地層已趨平穩約20年的臺北盆地近三年又出現下陷，且地層下陷區都有深開挖地基的特色，捷運工程的地下開挖深度達30公尺左右。“水利署”副署長吳約西表示，雖然最大下陷深度不到8公分，情況輕微，但地下水位不升反降甚至產生地層下陷，是20幾年來首見的異常警訊，應立即追蹤查明原因，并采取因應對策，以免情況惡化。
捷運挖30米 連續壁疑是禍首
臺北盆地局部下陷中，禍首指向捷運工程。環保團體批評應該把關的“環保署”玩忽職守，讓環評機制生銹，地下水位下降、地層下陷才會連年發生。
施做捷運新莊線的臺北市捷運局中區工程處長鄭國雄說，捷運開挖深達二、三十公尺，破壞地下水位平衡是必然的，重點是妥善控制的程度；若損壞沿線鄰房，該局都盡力修補。他指出，捷運工地采用深連續壁工法，直接阻斷地下水，讓地下水的流向自動改道，并沒有抽太多地下水，產生地層下陷，他也納悶。
鄭國雄也坦承，捷運施工前確有一套地下水抽取計劃，打了抽水井就要有補注井，把抽掉的水回注地底下，但“沒人知道補注井該打在哪里，也難評估效果”，最后這些地下水都排到水溝流掉了。但這項說法并未能說服環保團體。
環境質量文教基金會董事長劉銘龍說，當年的捷運環評報告書已要求施工單位，須注意新莊、蘆洲同屬地下水敏感地帶，應有防止沈陷、損壞民宅的監測系統與因應對策；監測結果證明臺北盆地已連續沈陷三年，顯然施工單位的自我要求不如預期，環評考核追蹤機制也“生銹”了。
地層為何下陷？大地技師林四川認為，可能是地下水抽過頭了。他說，超高大樓和捷運地基都要深開挖，為了阻擋地下水破壞工程結構，常用“連續壁”擋水，并把地基周圍的地下水抽干；由于抽掉的地下水量龐大，很可能破壞當地或沿線的地下水位平衡，導致地層下陷。
