與此同時，馬云極度自信。這樣的氣質，決定了他對領導權的絕對控制。關于這點，尖銳地體現在他尋找外界投資時，他在資金極度匱乏時毅然拒絕了30多家投資者，根本原因在于，馬云認識到價值觀的不同，最終會導致對他領導權的失勢。
在與金庸于西湖論道時，馬云用令狐沖自喻。他認為外界投資就如令狐沖體內的各種真氣，運用不好則生沖突，必痛徹心扉，只有用“易筋經”加以統御，才能唯我所用。而馬云自己的判斷和價值觀，才是阿里巴巴的“易筋經”。
如同“亂紅飛過秋千去”是“有我”之境一樣，因“物皆著我色”，阿里巴巴處處沾染了馬云的顏色。客觀點說，這家公司算是中國互聯網企業中少有的企業文化建設較為成功的一家。公司內部充斥著龐大的理想主義氛圍，和簡單易行的現實操作原則，且視原則如戒律，誰也不能越雷池半步。所以當“客戶欺詐門”一出，馬云揮淚斬衛哲等，竟能平息一段風波，不得不說，算一種奇跡。
理想主義者的一大痛苦就在于，世俗總是用復雜甚至陰謀的眼光來打量他們。過度的解讀使他們不堪其苦。馬云多次說到，他拒絕“劇作家”式的評論。同樣對于阿里巴巴模式，中國式的解讀往往呈現兩極，褒之者謂之為“全新的B2B模式”，新在何處？語焉不詳。貶之者謂之為“短命模式”，因何而終？莫衷一是……
應該說早期阿里巴巴的商業運作，是相當成功的商業范式。但當阿里巴巴在港上市成功，體量迅速擴大，直接的影響是企業的性質發生了根本變化。
還應該說馬云對電子商務的認識始終非常中國化，他認為電子商務B2B、B2C、C2C的幾種模式界限很不清晰，因此一直沒有進行有效的業務剝離。其根本性的認識起點，在于中國商貿市場的混沌。馬云甚至想創建一個B2B2C的全新互聯網模式，基本上可以涵蓋從生產到銷售，甚至再銷售的全部鏈條方式。
從2008年開始，這條鏈條逐步成型。人們不僅可以從阿里巴巴上買到生產資料，也能拍到球鞋。進而發展到今天可以在淘寶商城上買到鉆石和蘭博基尼……
于是外界紛紛將此解讀為企業的巨大成功，卻忽略了如此龐大的經營鏈條直接沖擊了國家層面的資金安全。這意味著，大量資金的流動將離開以銀行為體系的監管流程。尤其第三方支付平臺的支付寶，其政治意義就大過了經濟意義。
更重要的是，這個鏈條的建設基于一個假設前提，即中國經濟的高速發展。也就是說，鏈條最核心的環節，B2B的交易量增長和成長，必須要有足夠的速度和質量，才能拉動所有鏈條的增長。而2008年開始的世界經濟衰退，無異于為這個鏈條埋下了極大隱患。